Цель исследования. Разработка и валидация набора реагентов для количественного определения ДНК S. pneumoniae и H. influenzae методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Оценка его эффективности в сравнении с другими методами лабораторной диагностики.
Материалы и методы. Исследовали изоляты S. pneumoniae (181) и H. influenzae (101); биологический материал от пациентов с внебольничной пневмонией (ВП) тяжелого (60 взрослых) и среднетяжелого (66 детей) течения. Сравнивали результаты ПЦР-РВ, бактериологического метода и экспресс-теста на определение антигена S. pneumoniae в моче.
Результаты. В структуре возбудителей тяжелых ВП преобладали S. pneumoniae (63%), H. influenzae встречались у 32% пациентов. S. pneumoniae обнаруживали методом ПЦР-РВ в 2–3 раза чаще, чем другими методами диагностики. Методом ПЦР-РВ ДНК H. influenzae обнаружена в мокроте 19 больных, культура выделена только у 1. Этиологию ВП у детей установили в 91% случаев, из них вирусную – в 18%. S. pneumoniae выявлены у 17%, H. influenzae – у 23%.
Заключение. Показана высокая эффективность ПЦР-РВ для диагностики инфекций, вызванных S. pneumoniae и H. influenzae. При диагностике ВП методом ПЦР-РВ материал из нижних дыхательных путей более информативен, чем из верхних.
Исполняется 60 лет со дня основания ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора – головного научного учреждения России в области эпидемиологии, диагностики, патогенеза, терапии, специфической и неспецифической профилактики инфекционных болезней. В статье приводятся основные исторические вехи становления и развития института.
Академик В.И. Покровский первым в стране заложил основы научной школы эпидемиологии и профилактики внутрибольничных инфекций (ВБИ), создав профильную лабораторию в Центральном НИИ эпидемиологии. Впервые на государственном уровне под его руководством основные направления профилактики ВБИ были сформулированы в «Концепции профилактики внутрибольничных инфекций» (1999). Основные принципы и методология эпидемиологического надзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи (ИСМП), были разработаны в институте под руководством профессоров Н.А. Семиной и Е.П. Ковалевой. Научными трудами учеников В.И. Покровского (академиков В.Г. Акимкина и Н.И. Брико, член-корр. А.В. Тутельяна и др.) эта работа была продолжена. В настоящее время сформировался ряд научных проблем, являющихся приоритетными для здравоохранения Российской Федерации. Последовательная реализация актуальных направлений научных исследований в области эпидемиологии и профилактики ИСМП позволит оптимизировать существующую систему эпидемиологического надзора за данными инфекциями.
Цель исследования. Оценка генетического разнообразия циркулирующих в России изолятов Salmonella enterica subsp. enterica серовар Enteritidis, выделенных при случаях групповой и спорадической заболеваемости, с использованием данных полногеномного секвенирования.
Материалы и методы. Проведены полногеномное секвенирование и филогенетический анализ 460 изолятов S. Enteritidis, полученных в ходе работы референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами.
Результаты. Полученные данные позволили описать популяционную структуру российских изолятов S. Enteritidis и понять их филогенетическое положение в контексте глобального разнообразия патогена, оценить конкордантность эпидемиологических данных с данными генетической кластеризации и показать пространственно-временные особенности кластеризации изолятов, относящихся к эпидемиологически несвязанным случаям групповой заболеваемости.
Заключение. Результаты исследования создают предпосылки к созданию единой национальной лабораторно-информационной системы по мониторингу S. Enteritidis и расследованию эпидемических очагов групповой заболеваемости сальмонеллезами.
Цель исследования. Изучение уровня и структуры заболеваемости инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи (ИСМП), обусловленными стафилококками, в Российской Федерации в 2018–2021 гг.
Материалы и методы. Проанализированы данные статистических форм для проведения углубленного эпидемиологического анализа заболеваемости ИСМП, разработанных референс-центром по мониторингу за ИСМП Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора в дополнение к данным раздела 3 «Внутрибольничные инфекции» формы № 2 федерального статистического наблюдения «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях». Заболеваемость рассчитывали как относительную частоту случаев ИСМП, вызванных стафилококками, на 1000 госпитализированных пациентов. Данные по нозокомиальным инфекциям кровотока сравнили с открытыми данными на ресурсе https://amrmap.ru/.
Результаты. В течение 2018–2021 гг. наблюдалась тенденция к снижению заболеваемости ИСМП, вызванными стафилококками, в РФ. Средний многолетний темп убыли составил 21,2%. За анализируемый период было зарегистрировано 9468 случаев ИСМП, вызванных стафилококками. Средний показатель заболеваемости за 4 года составил 0,12 на 1000 госпитализированных пациентов. В структуре форм ИСМП среди зарегистрированных случаев, вызванных метициллинрезистентными стафилококками, вне пандемии, вызванной распространением коронавируса SARS-CoV-2, 1-е место занимали инфекции в области хирургического вмешательства. В 2020 г. лидирующее место заняли инфекции нижних дыхательных путей. Официальные данные об абсолютном числе случаев нозокомиальных инфекций кровотока, предоставленные территориальными органами Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, в 2018–2020 гг. оказались ниже реального числа инфекций кровотока.
Заключение. Несмотря на тенденцию к снижению заболеваемости ИСМП, обусловленными стафилококками, эти микроорганизмы остаются на 1-м месте в этиологической структуре ИСМП среди бактериальных возбудителей. Официальные данные о заболеваемости могут значительно отличаться от истинного числа случаев ИСМП, что требует регулярных эпидемиологических исследований и создания условий для оптимизации учета внутрибольничных инфекций.
Представлен повествовательный обзор состояния проблемы менингококковой инфекции в современном аспекте. Значительный перечень особенностей заболевания и беспрецедентная опасность инфекции способствовали разработке рациональной панели вакцин для специфической иммунопрофилактики. На примере реальных сценариев освещен вопрос стоимости заболевания с учетом совокупной стоимости лечения в стационаре и затрат на реабилитацию при возникновении инвалидизирующих последствий заболевания. Продемонстрированы значительные изменения в эпидемиологических проявлениях менингококковой инфекции на территории Российской Федерации и представлено обоснованное предостережение о возможности начала очередного периодического подъема заболеваемости менингококковой инфекцией.
Представлено краткое описание основных направлений научных исследований в области иммунопрофилактики, проведенных в Центральном НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора за 60 лет. Показано значение для развития вакцинопрофилактики разработанных коллективом лаборатории специфической профилактики инфекций под руководством проф. В.М. Болотовского основ вакцинопрофилактики кори и эпидемического паротита, дифтерии, коклюша; серомониторинга коллективного иммунитета к возбудителям вакциноуправляемых инфекций. Прослежена преемственность деятельности лаборатории иммунопрофилактики и Научно-методического центра иммунопрофилактики Роспотребнадзора по разработке унифицированной системы управления эпидемическим процессом с помощью вакцинопрофилактики, совершенствованию лабораторной составляющей эпидемиологического надзора за вакциноуправляемыми инфекциями и вакцинопрофилактикой – от серомониторинга до молекулярно-генетического мониторинга. Подчеркнуто значение создания нормативно-методической базы надзора за соблюдением температурного режима хранения и транспортирования иммунобиологических препаратов («холодовой цепью») и за безопасностью иммунизации.
В начале 2000-х гг. ВОЗ поставила вопрос о пандемии герпесвирусных инфекций в связи с их повсеместной распространенностью и инфицированием населения планеты с самого раннего возраста. Однако инфицирование макроорганизма еще не означает развития заболевания, требующего назначения терапии. В отношении герпесвирусных инфекций грань между состояниями, требующими коррекции, и состояниями, требующими динамического наблюдения, очень тонка. Клинический отдел инфекционной патологии Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора в течение 10 лет ведет активную научно-практическую работу по разработке диагностических и терапевтических алгоритмов тактики ведения пациентов разного возраста в зависимости от формы герпесвирусных инфекций. В статье представлены основные достижения сотрудников отдела за последние годы, обозначены перспективы дальнейших исследований.
Цель исследования. Сравнение эпидемиологических закономерностей распространения нарушений микробиоценоза кишечника среди населения Российской Федерации до и во время пандемии новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ результатов обследований на выявление нарушений микробиоценоза кишечника среди 72 798 пациентов в возрасте от 1 до 60 лет в периоды 01.2018–03.2020 и 04.2020–12.2022. Посев клинического материала на питательные среды и учет результатов проводили традиционными микробиологическими методами. Статистический анализ данных проводили с использованием стандартных методов описательной статистики с помощью программы Microsoft Office Excel 2010. Средние значения оценивали с учетом 95% доверительного интервала (95% ДИ) по методу Клоппера–Пирсона.
Результаты. В возрастной группе от 1 года до 60 лет выявлен рост нарушений микробиоценоза кишечника во время пандемии COVID-19 по сравнению с годами до пандемии. В 2018 – начале 2020 г. показатель не превышал 2,4 ± 0,02%, с 04.2020 он вырос до 77,9 ± 0,08%. Пандемия существенно изменила микробиоценоз кишечника в сторону преобладания условно-патогенной (Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp.) и патогенной (Salmonella spp., Shigella spp.) флоры.
Заключение. Показатели микробиоценоза кишечника у пациентов в возрасте от 1 года до 60 лет до пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 и во время пандемии значительно отличаются: происходит сдвиг в сторону увеличения дисбиоза, вызванного ростом условно-патогенной и патогенной флоры на фоне снижения облигатных симбионтов бифидобактерий, лактобактерий, энтерококков и типичной E. coli. Выявлено деструктивное влияние различных геновариантов вируса SARS-CoV-2 на кишечный микробиоценоз, выражающееся в повреждении филометаболического ядра, что может быть связано как с обширным применением антибиотиков, так и с повреждающим воздействием вируса на кишечник.
Несмотря на тенденцию к снижению регистрируемого числа случаев заболеваемости сибирской язвой (СЯ) среди животных и людей, многочисленные почвенные очаги (сибиреязвенные захоронения) диктуют необходимость проведения постоянного мониторинга за этой инфекцией. В статье представлены наиболее значимые результаты работы Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора в этом направлении: каталогизация случаев заболевания СЯ животных и людей, создание электронных кадастров стационарно неблагополучных по СЯ пунктов и сибиреязвенных захоронений, разработка методики комплексной оценки эпидемиологической опасности почвенных очагов СЯ, создание наборов реагентов для диагностики СЯ в формате ПЦР и ДНК-чипа.
Центральному НИИ эпидемиологии в этом году исполняется 60 лет. В статье представлена научная деятельность клинического отдела и его подразделений с конца 70-х гг. ХХ в. до наших дней. Освещены основные научные работы, которые проводились под руководством таких ученых, как профессора А.В. Змызгова и А.Р. Рейзис. В это время у больных вирусными гепатитами стали активно изучать клеточный и гуморальный звенья иммунитета, систему гемостаза, состояние антиоксидантной системы и перекисного окисления липидов, апробировать такие новые методы терапии, как гипербарическая оксигенация, плазмаферез, лазерная терапия, препараты интерферонов и др.
Представлена краткая история развития в Центральном НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора научных исследований, связанных с проникновением вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) на территорию Российской Федерации, его дальнейшим распространением, созданием и совершенствованием системы эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией, разработкой методов ее профилактики, диагностики и лечения.
Цель исследования. Наблюдение за циркуляцией возбудителей острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ), гриппа и COVID-19 среди лиц без симптомов острых респираторных инфекций (ОРИ) в разных возрастных группах и выявление особенностей эпидемического процесса путем мониторинга их возбудителей в еженедельном режиме.
Материалы и методы. Проведен анализ результатов мониторинга возбудителей ОРВИ, гриппа и COVID-19 у лиц без симптомов ОРИ с января 2021 г. по август 2022 г. Мазки из носо- и ротоглотки тестировали методом ПЦР. Статистическую обработку данных проводили с помощью программы MedCalc.
Результаты. Обследовано 273 846 чел., не имевших симптомов ОРИ, из них с положительным результатом – 16 665 чел. (6,09%). В структуре выявленных вирусов преобладают риновирусы – 46%, SARS-CoV-2 – 15%, коронавирусы человека (229E, OC43, HKUI, NL63) – 12%, доля остальных – от 0,05 до 9%.
Заключение. Установлены различия распространенности SARS-CoV-2 и риновируса в возрастных группах. Получены данные, свидетельствующие о наличии бессимптомного транзиторного носительства возбудителей ОРВИ в периоды подъема заболеваемости, характерного для риновирусов, SARS-CoV-2 и эпидемических коронавирусов человека. Выявлена прямая средняя корреляционная связь между инфицированностью SARS-CoV-2 бессимптомных лиц и заболеваемостью COVID-19.
Разнообразие и открытие новых респираторных вирусов, их изменчивость, быстрое формирование штаммов, резистентных к противовирусным средствам и модифицирующих адаптивные иммунные реакции у человека, приводят к возрастанию частоты вирусных микст-инфекций, что диктует необходимость разработки и внедрения новых алгоритмов диагностики и лечения таких пациентов.
В обзорной статье представлены научно-практические успехи и достижения сотрудников ЦНИИЭ по актуальным проблемам острых кишечных инфекций (ОКИ). Приводятся основные этапы развития диагностики, разработки новых алгоритмов терапии и профилактики ОКИ. Впервые была предложена и внедрена в практику классификация обезвоживания при холере и обоснована регидратационная терапия при холероподобных диареях. Разработаны адекватные современные методы расшифровки этиологической структуры инфекционных диарей, изучены клинико-эпидемиологические особенности кишечных инфекций, патогенез диареи и разработаны научно обоснованные современные подходы к диагностике, дифференциальной диагностике и тактике ведения пациента с ОКИ.
