№2/2026

25 июня 2026 г.

Выбрать рубрику

Выбрать рубрику
Выбрать рубрику
Абросимова О.А., Орлова О.А., Сычева Н.В., Туте­льян А.В., Акимкин В.Г.

Цель исследования. Изучение этиологической структуры возбудителей инфекций в области хирургического вмешательства (ИОХВ), инфекций нижних дыхательных путей (ИНДП), инфекций мочевыводящих путей (ИМВП).
Материалы и методы. Мониторинг возбудителей проводили по специально разработанным формам сбора данных на протяжении 7 лет на территории 36 субъектов Российской Федерации. Охват этиологической расшифровкой случаев ИОХВ, ИНДП, ИМВП за весь период наблюдения составил 84,43% (95% ДИ 80,38–88,48).
Результаты. Для ИМВП ведущими возбудителями были K. pneumoniae – 25,71% (95% ДИ 22,69–28,72), E. coli – 18,95% (95% ДИ 16,01–21,89) и Enterococcus spp. – 16,19% (95% ДИ 13,68–18,69). В этиологии ИНДП наибольшее значение имели: K. pneumoniae – 19,77% (95% ДИ 17,43–22,11), группа «другие микроорганизмы» – 14,96% (95% ДИ 6,14–23,78), группа «другие грамположительные микроорганизмы» – 11,37% (95% ДИ 9,43–13,31). В этиологической структуре ИОХВ за 7 лет преобладали: S. aureus – 20,56% (95% ДИ 19,91–21,21), E. coli – 17,3% (95% ДИ 16,41–18,20), K. pneumoniae – 12,37% (95% ДИ 11,68–13,07), S. epidermidis – 10,23% (95% ДИ 9,66–10,79).
Заключение. Этиологическая структура возбудителей ИСМП оставалась стабильной на протяжении периода наблюдения, но при сравнении результатов с данными других исследований наблюдаются территориальные особенности.

Показать
Эпидемическая ситуация
Агейкин А.В., Горелов А.В., Усенко Д.В., Рыбалкин С.Б., Курмаева Д.Ю., Богонина В.Е., Давыдова Р.Р.

Пандемия COVID-19 сопровождалась не только развитием острой респираторной патологии, но и ростом частоты отсроченных сердечно-сосудистых осложнений, что указывает на наличие сложных патогенетических взаимодействий в системе «вирус–хозяин». В настоящее время установлен мультисистемный характер поражения, обусловленный несколькими ключевыми механизмами. Первый связан с тропизмом вируса к тканям, экспрессирующим рецептор ангиотензинпревращающего фермента 2, что приводит к дисбалансу ренин-ангиотензин-альдостероновой системы с преобладанием провоспалительных, вазоконстрикторных и протромботических эффектов. Второй заключается в способности SARS-CoV-2, обладающего тропностью к сердечной ткани, инициировать сигнальный каскад некро­птоза кардиомиоцитов. Третий механизм реализуется посредством вирус-индуцированного гипометилирования промоторных регионов генов, кодирующих провоспалительные цитокины, что способствует формированию хронического системного воспаления и повреждению сосудистого эндотелия.
Заключение. Для идентификации ведущего патогенетического механизма, своевременного прогнозирования риска сердечно-сосудистых осложнений и определения тактики ведения пациентов необходима разработка и внедрение в клиническую практику стратегии качественной и количественной оценки специфических биологических маркеров. Их реализация позволит снизить показатели инвалидизации и смертности среди лиц, перенесших COVID-19.

Показать
Обзоры и лекции
Соломай Т.В., Семененко Т.А., Куликова М.М., Аким­кин В.Г.

Цель исследования. Анализ заболеваемости цитомегаловирусной инфекцией (ЦМВИ) в Российской Федерации в 2012–2024 гг. и определение вклада статистических данных в информационную базу эпидемиологического надзора за этой инфекцией.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный эпидемиологический анализ заболеваемости врожденной ЦМВИ и ЦМВ-болезнью в Российской Федерации в 2012–2024 гг. на основе данных формы статистического наблюдения № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях».
Результаты. Выявлены годы подъема и снижения показателей, группы риска заболевания по возрасту (самая высокая заболеваемость ЦМВ-болезнью зарегистрирована среди детей до 1 года, по мере увеличения возраста показатели снижались и были минимальными в группах лиц 15–17 лет и 18 лет и старше), выраженная неравномерность распределения показателей заболеваемости между городским и сельским населением, по федеральным округам и субъектам Российской Федерации.
Заключение. Мониторинг заболеваемости ЦМВИ является важным компонентом системы эпидемиологического надзора за ней, однако отсутствие единых подходов к постановке диагноза влечет за собой существенные погрешности в регистрации случаев заболеваний этой инфекцией и требует поиска дополнительных источников информации об эпидемическом процессе. Необходимы разработка и внедрение в медицинскую практику доступных и однозначных алгоритмов лабораторной диагностики ЦМВИ, а также использование возможностей серологического и молекулярно-биологического мониторингов.

Показать
Эпидемическая ситуация
Гришаева А.А., Чернышова А.С., Понежева Ж.Б., Мака­шова В.В., Маннанова И.В., Омарова Х.Г., Хафизов К.Ф., Чанышев М.Д.

Цель исследования. Определение распространенности мутаций лекарственной резистентности вируса гепатита C (ВГС) генотипа 3a к препаратам прямого противовирусного действия (ПППД).
Материалы и методы. В исследование были включены 44 пациента с диагнозом «хронический гепатит С, генотип 3а». Пять (11,4%) пациентов имели в анамнезе опыт терапии хронического гепатита С ПППД с отсутствием вирусологического ответа. Секвенирование РНК ВГС осуществляли при помощи NGS-панели HCV-seq.
Результаты. Для всех образцов получены геномные последовательности и проанализированы мутации резистентности к терапии. Наблюдали следующую частоту встречаемости мутаций в NS3: A166S/T – 20,5%, D168R – 2,3%, I170V – 11,4%, в NS5a: A30K/S/T – 9,1%, L31I – 2,3%, S62T/L – 22,7%, Y93H – 4,5%, в NS5b: K100R – 2,3%. У 5 пациентов c опытом неуспешной терапии ПППД в анамнезе проанализированы квазивиды на наличие мутаций резистентности к терапии: у пациента 1 была выявлена мутация A30K, при анализе квазивидов в 10 и 14% прочтений регистрировались P32L и Y93H соответственно. У пациента 2 обнаружены мутации 28M и 62L и квазивариант A30S (10%). Вирусный геном у пациента 3 также содержал мутации 28M и 62L, квазивиды вируса отсутствовали. У пациента 4 была обнаружена мутация A30K, у пациента 5 – S62L.
Заключение. Исследование мутаций резистентности ВГС целесообразно у пациентов с неуспешной терапией в анамнезе. Дополнительный анализ квазивидов позволяет выявить скрытые мутации резистентности, которые могут приводить к неэффективности лечения и рецидивам инфекции. 

Показать
Оригинальные исследования

Распространенность мутаций лекарственной резистентности вируса гепатита C генотипа 3а к препаратам прямого противовирусного действия

Без рубрики
Ветров В.В., Иброхимова А.Д., Крутикова Д.С., Трифонова Г.Ф., Эсауленко Е.В.

Цель исследования. Оценка динамики, возрастных, территориальных и иных особенностей заболеваемости гепатитом А (ГА) в Российской Федерации (РФ).
Материал и методы. Проанализированы данные государственной статистической отчетности инфекционной заболеваемости в РФ (форма № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях») за период 2009-2024 гг., материалов Научно-методического центра НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера и Референс-центра по мониторингу за вирусными гепатитами Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Использованы эпидемиологический и статистический методы исследования.
Результаты. В РФ в 2009–2021 гг. заболеваемость гепатитом А снизилась с 7,3 до 1,5 на 100 тыс. населения, однако отмечались подъемы в 2014 г. (7,2) и 2017 г. (5,5). Минимум заболеваемости (2021 г.) совпал с пиком пандемии COVID-19, с 2022 г. наблюдается рост показателя: 1,6 (2022), 2,4 (2023), 3,2 (2024) на 100 тыс. населения (p < 0,05). Проявление эпидемического процесса гепатита А на территориях РФ неравномерно. Наиболее высокие показатели заболеваемости – в Центральном и Уральском федеральных округах, особенно в Брянской, Рязанской областях, ХМАО-Югре, Челябинской области. В Южном, Северо-Кавказском и Дальневосточном федеральных округах заболеваемость стабильно ниже среднероссийской. В ряде субъектов (Калмыкия, Кабардино-Балкария, Чечня, Ингушетия) в отдельные годы случаи ГА не регистрировались. Заболеваемость городского населения выше, чем сельского; детского (0–17 лет) – выше, чем взрослого. Среди детей доминирует группа 3–6 лет. За 2019–2024 гг. зарегистрировано 36 вспышек гепатита А, число субъектов со вспышками сократилось с 10 до 4.
Заключение. Многолетняя динамика заболеваемости ГА в РФ характеризуется цикличностью (межэпидемический интервал составляет 3–8 лет). Снижение заболеваемости в доковидный период привело к накоплению восприимчивого населения и создало риск новых подъемов. Рост показателей с 2022 г. требует усиления эпидемического надзора, особенно в неблагополучных регионах. Преобладание заболеваемости среди детей 3–6 лет определяет целесообразность включения вакцинации против ГА в национальный календарь профилактических прививок для этой возрастной группы. Увеличение числа привитых в 2024 г. по сравнению с предыдущими годами в 2 раза является мощным профилактическим мероприятием, наряду с соблюдением противоэпидемического режима.

Показать
Эпидемическая ситуация
Кравченко А.В., Елистратова Т.А., Беляева В.В., Соколова Е.В.

Цель исследования. Оценка структуры рисков нарушения приверженности диспансерному наблюдению и лечению ВИЧ-инфекции пациентов, поступивших на лечение в многопрофильный стационар.
Материалы и методы. Исследование проводили методом прямого письменного опроса с помощью заранее подготовленных бланков анкет после получения информированного согласия респондента. Опрошено 68 пациентов, 45 мужчин и 23 женщины, в возрасте от 24 до 73 лет. На вопрос о приеме антиретровирусной терапии (АРТ) ответили 42 пациента. Постоянно получали лечение 29 больных, 2 пациента терапию прервали, а 11 больных АРТ не получали. Неопределяемый уровень РНК ВИЧ отмечен в 31 протоколе анкетирования. У 8 чел. заболевание закончилось летальным исходом. Лишь 1 из 8 умерших получал АРТ.
Результаты. Наиболее частыми признаками когнитивного неблагополучия были трудности концентрации внимания, подбора слов и снижение памяти на недавние события. Умеренная и выраженная депрессивная симптоматика выявлена у 17,6% респондентов, положительный результат скрининга злоупотребления алкоголем – у 22,5%. Высокий уровень стигматизации в связи с ВИЧ-инфекцией отметили 35,3% пациентов. Более четверти больных АРТ не получали, 4,8% пациентов терапию прервали. Статистически значимые корреляционные связи пропусков приема АРТ выявлены с забывчивостью при приеме препаратов (p = 0,000), выраженностью депрессивной симптоматики (p = 0,002), злоупотреблением алкоголем (p = 0,004), а также с низкой самооценкой памяти (p = 0,001) и состояния здоровья (p = 0,005).
Заключение. Наиболее актуальными рисками нарушения приверженности лечению ВИЧ-инфицированных пациентов были недоброжелательное отношение окружающих в связи с ВИЧ-инфекцией, положительный результат скрининга на злоупотребление алкоголем и забывчивость при приеме АРТ.

Показать
Оригинальные исследования
Редакция

20 мая 2026 г. скончался Вадим Валентинович ПОКРОВСКИЙ – выдающийся российский ученый, действительный член Российской академии наук, заведующий специализированным научно-исследовательским отделом по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН «Центральный науч­но-иссле­довательский инс­титут эпидемиологии» Рос­пот­ребнадзора, заслуженный деятель науки РФ.

Показать
Некрологи
Битюмина Л.А., Ярославцева М.А., Парамонова С.Н., Королева И.Б., Куликова Н.Г., Михайлова Ю.В., Шеленков А.А., Паневина А.В., Манзенюк И.Н., Акимкин В.Г.

Цель исследования. Оценка профиля устойчивости к противомикробным препаратам у изолятов Salmonella, выделенных из пищевых продуктов в Российской Федерации в 2018–2024 гг., с помощью фенотипического анализа и выявления генетических детерминант антибиотикорезистентности.
Материалы и методы. В 2018–2024 гг. проанализированы 3843 изолята нетифоидных Salmonella enterica subsp. enterica, полученных из пищевой продукции на территории России. Родовую идентификацию выполняли методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Серотипирование проводили реакцией агглютинации с использованием отечественных сальмонеллезных сывороток (ПЕТСАЛ, Россия) по схеме Кауффмана–Уайта. Фенотипическую чувствительность определяли методом серийных разведений в бульоне (МПК) на анализаторе Vitek 2 Compact. У мультирезистентных (MDR) изолятов гены антибиотикоустойчивости определяли с помощью полногеномного секвенирования (WGS).
Результаты. Наиболее часто Salmonella выделяли из птицепродукции (55,8%), кулинарной продукции (27,5%) и мясной продукции (14,2%); менее 1% изолятов получено из кондитерских, рыбных и молочных изделий. Зарегистрирована фенотипическая устойчивость к цефалоспоринам (18,1%), фторхинолонам (60,1%), аминогликозидам (18,1%), тетрациклинам (36,7%), хлорамфениколу (27,0%), триметоприму (66,1%), нитрофурантоину (59,1%), триметоприм-сульфаметоксазолу (21,9%) и карбапенемам (0,1%). Методом WGS изучено 31,2% выборки. Среди сиквенс-типов преобладали ST32 (S. Infantis), ST11 (S. Enteritidis), ST198 (S. Kentucky) и ST34 (S. Typhimurium). В геномах выявлены детерминанты резистентности к аминогликозидам (93,0 %), β-лактамам (46,4%), хинолонам (31,0%), тетрациклинам (97,4%), сульфаниламидам (89,6%), триметоприму (59,8%), фениколам (41,1%), макролидам (57,9%), а также (реже 1%) к линкозамидам, колистину и рифампицину.
Заключение. Птицепродукция является основным резервуаром сальмонелл, циркулирующие изоляты демонстрируют высокий уровень устойчивости к клинически значимым антибиотикам, прежде всего к фторхинолонам и триметоприму. Доминирование эпидемиологически значимых клонов (ST32, ST11, ST198, ST34) подчеркивает необходимость усиления контроля на всех этапах пищевой цепи и продолжения молекулярно-генетического мониторинга для отслеживания распространения резистентных клонов.

Показать
Оригинальные исследования
Голошва Е.В., Алешукина А.В., Маркова К.Г., Бере­зинская И.С.

Цель исследования. Определение критериев риска возникновения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), в медицинских организациях (МО) Ростова-на-Дону и Ростовской области.
Материалы и методы. За 2012–2024 гг. внутри стационаров выделено 2709 культур неферментирующих грамотрицательных бактерий (НГОБ), изучена их видовая принадлежность, чувствительность к антибиотикам и способность к биопленкообразованию. Проведены бактериологические исследования и определение антибиотикочувствительности диско-диффузионным методом. Биопленкообразование НГОБ оценивали авторским способом. Для выявления локусов антибиотикорезистентности исследовали рандомно выбранные 13 штаммов Pseudomonas aeruginosa, выделенных из разных источников.
Результаты. Частота выявления НГОБ в стационарах города колебалась от 5 до 28%. Наиболее часто встречались: Pseudomonas aeruginosae, Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter baumanii. Отмечены высокая стабильная частота встречаемости и степени обсемененности панантибиотикорезистентных НГОБ, нарастание их антибиотикорезистентности и способности к биопленкообразованию. Пилотное исследование локусов антибиотикорезистености псевдомонад показало, что количество выявленных клинически значимых генов R-АБ в псевдомонадах можно расположить в порядке убывания: tetO > aadA2 > blaVIM > ermB > vanA > sul2.
Заключение. Критериями риска возникновения ИСМП в МО следует считать выявление доминирующих потенциально опасных культур микроорганизмов, наличие среди изолятов штаммов, устойчивых к нескольким группам антибиотиков, отсутствие чувствительности к дезсредствам. Мониторинг антибиотикорезистентности штаммов НГОБ может позволить скорректировать схемы назначения антибактериальных препаратов в МО, оценить риски возникновения ИСМП и разработать соответствующие противоэпидемические мероприятия.

Показать
Оригинальные исследования
Лужецкая А.А., Пшеничная Н.Ю., Гопаца Г.В., Морозкин Е.С., Акимкин В.Г.

Цель исследования. Комплексный анализ клинико-эпидемиологических особенностей завозных случаев лихорадки денге (ЛД) у пациентов, проживающих на неэндемичной территории, и оценка взаимосвязи между тяжестью заболевания, серотипом вируса (DENV) и маркерами эндотелиальной дисфункции.
Материалы и методы. В исследование включен 51 пациент с ЛД, госпитализированный в инфекционные стационары г. Москвы в 2024–2025 гг. Серотипирование выполняли методом ПЦР; IgM, IgG и цитокины (фактор некроза опухоли α, интерлейкины (ИЛ) 1β, 8, 10) определяли методом ИФА; фактор фон Виллебранда – методом агглютинации. Тяжесть ЛД оценивали по классификации ВОЗ (2009).
Результаты.  В исследуемой группе преобладали женщины (62,7%), средний возраст составил 33,9 года. Основные страны завоза: Мальдивы, Таиланд и Индонезия. Доминировал серотип DENV-3 (43,1%), реже встречались DENV-2 (31,4%) и DENV-1 (25,5%); DENV-4 не выявлен. DENV-2 чаще ассоциировался с завозом ЛД с Мальдив, DENV-3 – с Таиландом и Шри-Ланкой. В структуре форм преобладала ЛД без предвестников (ЛД-П) (64,7%), ЛД с предвестниками (ЛД+П) составила 33,3%, тяжелая ЛД – 2,0%. У всех пациентов с ЛД+П и тяжелой ЛД наблюдался геморрагической синдром. Основные симптомы: лихорадка, слабость, артралгии, сыпь и диарея. Характерны лейкопения, лимфопения и тромбоцитопения. При инфицировании DENV-2 отмечались более выраженные лейко- и нейтропения, DENV-3 – повышение уровня аланинаминотрансферазы. ЛД+П чаще встречалась у женщин, сопровождалась более выраженными гематологическими и коагуляционными нарушениями, а также повышением содержания ИЛ-10 (p = 0,01) и фактора фон Виллебранда (p = 0,024);
Заключение. Полученные данные подтверждают целесообразность использования иммунологических, эндотелиальных и биохимических маркеров в сочетании с серотипированием вируса для совершенствования эпидемиологического надзора и оценки тяжести течения завозных случаев ЛД.

Показать
Оригинальные исследования
Гималдинова Н.Е., Любовцева Л.А., Гурьянова Е.А.

Цель исследования. Изучение количества и соотношения СD4+- и СD8+-лимфоцитов в легких, пораженных очаговым туберкулезом.
Материалы и методы. Исследование выполнено на аутопсийном материале легких 40 умерших мужчин в возрасте 30–55 лет с прижизненно диагностированным очаговым туберкулезом. Для оценки иммунного ответа использовали иммуногистохимические методы исследования.
Результаты. При исследовании локализации экспрессии изучаемых маркеров в легких в группе «условно здоровые» большинство СD4+- и СD8+-лимфоцитов определялось преимущественно в интерстициальном пространстве, единичные – около кровеносных сосудов и в собственной пластинке слизистой оболочки бронхов. При очаговом туберкулезе наибольшее число CD4+-лимфоцитов обнаружено в грануляционной ткани (12,2 ± 1,9 в п/зр.), окружающей очаг казеозного некроза. В зонах без признаков воспаления количество клеток уменьшалось (4,2 ± 1,3 в п/зр.). CD8+-лимфоциты преобладали над CD4+-лимфоцитами как в зоне вокруг некроза (48,8 ± 5,8 в п/зр.), так и в отдаленных участках (12,3 ± 0,3 в п/зр.). Иммунорегуляторный индекс (CD4+/CD8+) в очаге туберкулезного процесса и в зоне без признаков специфического воспаления составил 0,25 и 0,34 соответственно, что говорит о подавлении местного клеточного иммунитета.
Заключение. При очаговом туберкулезе нарушается равновесие между Т-хелперами (CD4) и Т-супрессорами (CD8) в очаге специфического воспаления. Установленные количественные изменения и снижение иммунорегуляторного индекса в исследуемых зонах могут служить объективными критериями развития локального иммунодефицита и рассматриваться как маркеры для уточнения прогноза течения заболевания и выбора тактики иммунокоррекции.

Показать
Оригинальные исследования
Акимкин В.Г., Есьман А.С., Дубоделов Д.В., Гаса­нов Г.А., Махова Т.И., Береговых Р.М., Монахова А.А., Сычева Н.В.

Цель исследования. Определение эпидемиологической значимости доли бессимптомных и легких форм в динамике уровня и структуры заболеваемости новой коронавирусной инфекцией (COVID-19) в мире и в Российской Федерации (РФ) за 2020–2022 гг.
Материалы и методы. Для анализа заболеваемости COVID-19 населения разных стран мира использованы данные интернет-ресурса Our World in Data. Сведения об уровне и динамике заболеваемости населения РФ и распределении заболевших по степени тяжести получены при анализе статистической формы Роспотребнадзора №1035 «Мониторинг количества заболевших коронавирусной инфекцией, в том числе внебольничными пневмониями, и летальных исходов» за 2020–2022 гг.
Результаты. Суммарное значение доли бессимптомных и легких форм заболевания в 2020–2022 гг. колебалось от 51,5 до 80,6% и в среднем составило 64,2 ± 10,6%.
Заключение. Высокие доли бессимптомных и легких форм COVID-19 свидетельствуют о чрезвычайной эпидемиологической значимости своевременной диагностики таких случаев заболевания для профилактики распространения возбудителя.

Показать
Эпидемическая ситуация
Еремеева Ж.Г., Патяшина М.А.

С момента начала вакцинации населения нашей страны от гепатита В отмечается тенденция к снижению показателей заболеваемости острой формой с 47,3 случая на 100 тыс. в 1999 г. до 0,32 случая на 100 тыс. населения к 2024 г. Регистрация хронического гепатита В, начатая в 1999 г., демонстрирует снижение за 1999–2024 гг. максимального значения (16 в 2001 г.) в 1,7 раза (9,45 в 2024 г). Как показал анализ результатов исследований эпидемического процесса при вирусном гепатите В до и после старта вакцинации, опубликованных в отечественной и зарубежной литературе, актуальными остаются вопросы изучения популяционного и индивидуального иммунитета путем серологического мониторинга с изучением причин «неответа» на вакцинацию и ревакцинацию на молекулярно-генетическом уровне с целью прогнозирования адекватного иммунного клеточного ответа, поскольку сохраняются риски инфицирования ввиду недостаточного охвата диагностикой групп риска: мигрантов, а также отсутствия регистрации латентных форм инфекции.

Показать
Эпидемическая ситуация
Винокурова О.О., Буракова М.В., Чотчаев Р.М.

На основе изучения отечественных и зарубежных публикаций представлено сравнение диагностических возможностей Диаскинтеста и IGRA-тестов в выявлении туберкулезной инфекции. Показано, что Диаскинтест® и IGRA-тесты основаны на выявлении клеточного иммунного ответа к антигенам ESAT-6/CFP-10, что обеспечивает их высокую специфичность. Чувствительность IGRA составляет 0,81–0,90, специфичность – 0,95–0,99. Диаскинтест® демонстрирует сопоставимую диагностическую эффективность при высокой специфичности в популяциях, вакцинированных БЦЖ. Методы имеют общую антигенную основу, но различаются по механизму регистрации иммунного ответа и являются взаимодополняющими.

Показать
Обзоры и лекции
Стома И.О., Цейко З.А., Ковалев А.А., Воропаев Е.В., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С.

Цель исследования. Сравнительный анализ состава кишечной микробиоты пациентов с хронической HCV-инфекцией, инфицированных вирусом генотипов 1 и 3, с учетом половозрастных особенностей. Материалы и методы. Проведено одноцентровое поперечное клиническое исследование, в которое включены 119 пациентов с хроническим гепатитом С. Определен состав микробного разнообразия кишечника методом метагеномного секвенирования 16S рРНК. Высокопроизводительное секвенирование проводили с помощью генетического анализатора MiSeq (Illumina, США) с использованием протокола, основанного на анализе вариабельных регионов гена 16S рРНК. Данные анализировали с использованием Kraken2. Результаты. У пациентов с генотипом 1 HCV отмечено увеличение численности таких таксонов, как Helicobacter (padj < 0,001), Shewanella (padj = 0,101), Terribacillus (padj < 0,001), Providencia (padj = 0,050), Coprobacter (padj < 0,001), Duodenibacillus (padj = 0,044), Paraclostridium (padj = 0,008), Monoglobus (padj < 0,001) и др. А у пациентов с генотипом 3 HCV – Yersinia (padj = 0,003), Citrobacter (padj = 0,010), Brevibacterium (padj = 0,001), Latilactobacillus (padj <0,001), Butyrivibrio (padj = 0,085), Bombilactobacillus (padj < 0,001) и др. Заключение. При инфицировании генотипом 1 HCV отмечено изменение метаболического баланса с увеличением численности условно-патогенных микроорганизмов, сульфатредуцирующих бактерий (Nitratidesulfovibrio (padj = 0,014) и бактерий, участвующих в метаболизме желчных кислот (Gordonibacter (padj = 0,112)). У пациентов с генотипом 3 наблюдается смешанная картина: увеличивается численность потенциальных патогенов и сохраняется представленность полезных бактерий.

Показать
Оригинальные исследования
Старикова В.А., Константинов Д.Ю., Коннова Т.В.

Цель исследования. Изучение состава микробиома мокроты у пациентов с пневмококковой пневмонией в зависимости от представленности компонентов метаболического синдрома.
Материалы и методы. Обследовано 38 пациентов с пневмококковой пневмонией, стратифицированных на 3 группы в соответствии с критериями метаболического синдрома Международной федерации диабета (International Diabetes Federation, IDF): группа A (n = 17): абдоминальное ожирение + сахарный диабет 2-го типа + артериальная гипертензия + гипертриглицеридемия; группа B (n = 12): абдоминальное ожирение + сахарный диабет 2-го типа + сниженный уровень липопротеинов высокой плотности; группа C (n = 9): абдоминальное ожирение + артериальная гипертензия + гипертриглицеридемия. Идентификацию Streptococcus pneumoniae осуществляли культуральным методом и MALDI-TOF MS; таксономический анализ – секвенированием 16S рРНК.
Результаты. Наибольшая бактериальная нагрузка S. pneumoniae и наиболее медленная ее элиминация на фоне терапии наблюдались в группе А (7,2 × 10⁶ КОЕ/мл) и группе B (5,8 × 10⁶ КОЕ/мл). Микробиота пациентов групп А и B характеризовалась выраженным дисбиозом с доминированием Streptococcus (49,1 ± 2,4%) и сочетанным повышением условно-патогенных родов (Haemophilus, Klebsiella), тогда как в группе C преобладали комменсальные таксоны (Prevotella, Veillonella). Индекс дисбиоза был максимальным в группе A (3,8 ± 0,3) и минимальным в группе C (0,6 ± 0,1) (p < 0,001).
Заключение. Выраженный дисбиоз дыхательных путей регистрировали у пациентов с метаболическим синдромом, обязательным компонентом которого был сахарный диабет 2 типа.

Показать
Оригинальные исследования